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        復(fù)旦大學(xué)牽頭實施人類表型組國際大科學(xué)計劃——

        探索人體宇宙 破解生命密碼

        發(fā)布時間:2025-01-04 作者:本報記者 高毅哲 來源:中國教育報

        復(fù)旦大學(xué)人類表型組研究院科研人員在分析數(shù)據(jù)。學(xué)校供圖

          “你肯定知道人類基因組計劃?!?/p>

          2024年11月,上海,復(fù)旦大學(xué)人類表型組研究院的會議室內(nèi),田梅端詳了一下記者,問道。

          田梅是研究院執(zhí)行院長、世界分子影像學(xué)會主席。面對科學(xué)家,記者老實承認:“我記得世紀(jì)之交,人類基因組計劃是街頭巷尾熱議的話題。大家都說,它會讓每個人知道自己的生老病死?!?/p>

          “沒錯,1999年,中國科學(xué)家正式加入人類基因組計劃,承擔(dān)1%的測序任務(wù)?!碧锩愤呎f邊打開面前的電腦,一份PPT投影到會議室前方巨大的屏幕上,標(biāo)題赫然顯現(xiàn)——人類表型組國際大科學(xué)計劃。

          在人類基因組計劃完成20多年后,中國科學(xué)家轉(zhuǎn)變角色,率先系統(tǒng)提出開展人類表型組國際大科學(xué)計劃的科學(xué)倡議,并在復(fù)旦大學(xué)建成全球三大表型組學(xué)研究中心之一。

          各國科學(xué)家們再次集結(jié),向人體和生命奧秘開始新的進軍。

          率先布局,開啟表型研究

          機體的運行、疾病的產(chǎn)生、器官的興衰……從古至今,人體的奧秘吸引了無數(shù)科學(xué)家探索。

          在過去的40年,生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域發(fā)展的主要驅(qū)動力來自人類基因組計劃。然而隨著研究的深入,人們發(fā)現(xiàn),基因組無法解釋所有疾病的致病原因。盡管基因組已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了大量疾病靶點,但依然有很多疾病沒有找到對應(yīng)的基因靶點。

          2015年5月,北京香山飯店。1993年正式創(chuàng)辦的香山科學(xué)會議舉行第525次會議,這次會議首次聚焦“國際人類表型組研究”這一問題。

          “生命科學(xué)發(fā)展遇到新瓶頸,需要科研范式轉(zhuǎn)換。”“亟須系統(tǒng)深入進行人群表型特征的精確測量,利用大數(shù)據(jù)手段,建立基因與表型的關(guān)聯(lián),為我國生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的自主創(chuàng)新和跨越式發(fā)展提供科技支撐?!薄罱K,大家一致倡議,發(fā)起人類表型組國際大科學(xué)計劃。

          表型,是指生命體的各種特征。

          有的肉眼可見:單雙眼皮、直發(fā)卷發(fā)、喝酒是否容易臉紅……有的肉眼不可見:靜息代謝、皮膚表面菌群……各種表型全部統(tǒng)合起來,就是表型組。

          人類表型組國際大科學(xué)計劃,就是通過系統(tǒng)精密的跨尺度測量,積累海量的生物信息大數(shù)據(jù),再對這些數(shù)據(jù)進行分析建模,進而發(fā)現(xiàn)還未被人類發(fā)現(xiàn)的基因—表型—環(huán)境以及宏觀—微觀表型之間的關(guān)聯(lián)機制,最終實現(xiàn)對疾病更加精準(zhǔn)的診斷、干預(yù)、調(diào)控和治療。

          “某種意義上,表型組學(xué)是基因組學(xué)的延伸?!敝袊茖W(xué)院院士、復(fù)旦大學(xué)校長、人類表型組研究院院長金力說。他是香山科學(xué)會議的參會者之一,也是人類表型組國際大科學(xué)計劃的發(fā)起人之一。

          金力經(jīng)常用的一個比喻是:“如果說人類基因組計劃讓科學(xué)家手里有了探索生命奧秘的指南針,那么人類表型組國際大科學(xué)計劃將打造未來遨游生命科學(xué)世界的全球衛(wèi)星定位系統(tǒng)?!?/p>

          從一開始,人類表型組國際大科學(xué)計劃就被定位為“國際大科學(xué)計劃”。

          “我們當(dāng)然可以在中國人中做,或者在某一個國家、某一個民族人群中做。”金力說,“但是,表型本身在全球不同人種、不同人群之間存在較大差別。如果我們不能利用這種差別來增加表型的多樣性,那就太可惜了?!?/p>

          早在2014年,復(fù)旦大學(xué)便開始籌備發(fā)起工作。2018年,上海市首批市級科技重大專項“國際人類表型組計劃(一期)”啟動,由復(fù)旦大學(xué)牽頭,中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院等承擔(dān)。

          隨后,中國科學(xué)家聯(lián)合國際上志同道合的頂尖學(xué)者,共同發(fā)起成立了國際人類表型組研究協(xié)作組(IHPC)和中國人類表型組研究協(xié)作組(HPCC)。人類表型組國際大科學(xué)計劃正式啟航。

          四個第一奠定引領(lǐng)優(yōu)勢

          “你有機會可以當(dāng)我們的志愿者,接受一個‘超級體檢’?!痹诼?lián)系采訪之初,研究院工作人員就對記者發(fā)出邀請,“如果折算成市場價格,這個體檢價值十萬元。”

          “超級體檢”的真名,叫“自然人群隊列健康表型研究”。研究院的3樓是人類表型組計劃的“檢測中心”。志愿者要在這里用兩天一夜的時間,檢查2.4萬個指標(biāo),也就是2.4萬個表型。

          支撐起這一龐大檢測的,是十幾個檢測室,以及讓人眼花繚亂的設(shè)備,還有一整套流程。精密測量平臺主任羅競春帶著記者逐個參觀。

          “這個,用來測皮膚表面的菌群。所以檢測當(dāng)天,額頭、前臂、頭皮和后背都不要接觸水。”

          “這是腦電檢測,測量人在靜息狀態(tài)下的自發(fā)性神經(jīng)活動。戴上電極帽,你的腦電信號會實時出現(xiàn)在面前的電腦屏幕上?!?/p>

          還有一間小臥室,志愿者需要佩戴電極帽、血氧儀等監(jiān)測設(shè)備在這里睡一晚。此外,還有一個攝像頭。“攝像頭會在22點打開,直到第二天6點?!绷_競春說,“睡覺的各種狀態(tài),也是表型數(shù)據(jù)?!?/p>

          看起來,似乎也就是比一般體檢全面一些?!笆f元”的價值,如何體現(xiàn)?

          “表型測量,關(guān)鍵在于精密。測量方法精密,測量細節(jié)也同樣精密。”羅競春說,“比如志愿者測量多久再休息多久可以達到最佳效果,都經(jīng)過精密設(shè)計。”

          好似一名向?qū)?,羅競春撥開拼圖中的迷霧。隨著迷霧全部散去,拼圖完整呈現(xiàn)。

          “你剛才看到、聽到的所有一切,正式名稱是全球第一個‘跨尺度多維度人類表型精密測量平臺’及其全套標(biāo)準(zhǔn)作業(yè)程序體系?!绷_競春微笑著說。這是他和同事們5年多的心血,目前居于世界領(lǐng)先地位。

          這是中國在人類表型組這一生物醫(yī)學(xué)最前沿的領(lǐng)先實力最直觀的展示。

          在這個平臺及作業(yè)體系里,完成了超過1400人、每人測量2.4萬個表型的健康人群表型精密測量千人核心隊列——這是第一個“全球第一”。

          依據(jù)上述數(shù)據(jù),中國科學(xué)家繪制了全球首版人類表型組導(dǎo)航圖,發(fā)現(xiàn)150余萬個表型間強關(guān)聯(lián),其中絕大多數(shù)是科學(xué)界首次發(fā)現(xiàn);研發(fā)全球首個多組學(xué)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)“中華家系1號”,并獲頒8個國家一級標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)認證——第三、第四個全球第一。

          也就是說,中國科學(xué)家的工作,在“測什么”“怎么測”“怎么算”等核心問題上,為建立國際性表型組學(xué)研究的“標(biāo)準(zhǔn)操作程序”作出了重要貢獻?!吧鲜龉ぷ骰镜於酥袊谌祟惐硇徒M國際大科學(xué)計劃中的引領(lǐng)優(yōu)勢?!碧锩氛f。

          統(tǒng)籌資源展示高校擔(dān)當(dāng)

          截至目前,國際人類表型組研究協(xié)作組由來自20個國家的23位科學(xué)家(其中14位各國院士)組成,中國人類表型組研究協(xié)作組由來自國內(nèi)137名協(xié)作委員(其中38位院士)和91家協(xié)作單位組成。

          統(tǒng)籌實施好國內(nèi)外各種資源,穩(wěn)步推進國際大科學(xué)計劃,是一項和科研工作同等重要的任務(wù)。

          “人類表型組國際大科學(xué)計劃源起于中國。我們有責(zé)任把這個計劃組織實施好,展現(xiàn)中國高校的責(zé)任擔(dān)當(dāng)、能力水平?!碧锩氛f。

          研究院也是《表型組學(xué)(Phenomics)》期刊編輯部所在地。

          這本期刊,是復(fù)旦大學(xué)主辦的同行評審國際期刊,錨定打造表型組學(xué)國際頂尖期刊目標(biāo),組建起包括中、美、德、英、澳、日、韓等25個國家36位頂尖科學(xué)家的國際化編委會。

          研究院副院長、期刊執(zhí)行主編丁琛說:“期刊承載著前沿創(chuàng)新策源與國際科技協(xié)同的重大使命,是中國為人類表型組國際大科學(xué)計劃打造的重要國際公共產(chǎn)品與學(xué)術(shù)平臺?!?/p>

          包括期刊在內(nèi),在復(fù)旦大學(xué)人類表型組研究院等科研機構(gòu)的努力下,中國已為人類表型組國際大科學(xué)計劃打造四大科技公共產(chǎn)品。另外3項是:人類表型組系列國際國內(nèi)高端學(xué)術(shù)大會、國際人類表型組標(biāo)準(zhǔn)化創(chuàng)新中心和生命健康科技智庫。

          與此同時,中國科學(xué)界引領(lǐng)兩大協(xié)作組達成一系列國際科研共識與文件,包括明確人類表型組大科學(xué)計劃的主要目標(biāo)、技術(shù)路徑和優(yōu)先研究方向,發(fā)布《人類表型組相關(guān)測量框架性指南》,啟動全球已有的深度表型組隊列之間的協(xié)同比較研究,等等。

          “人類表型組國際大科學(xué)計劃的推進實施,有助于上海打造長期支撐服務(wù)生物醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)的創(chuàng)新引擎,進而建成具有全球影響力的科技創(chuàng)新中心,成為吸引全球優(yōu)秀科學(xué)家的人才蓄水池?!碧锩氛f,通過打造更多的標(biāo)志性戰(zhàn)略成果,高校在服務(wù)國家和區(qū)域戰(zhàn)略上,會發(fā)揮越來越關(guān)鍵的支撐作用。

          研究院的墻壁上,鐫刻著人類科學(xué)先驅(qū)伽利略的名言:“測一切之可測,并使不可測變?yōu)榭蓽y?!?/p>

          田梅輕敲鍵盤,一個球狀模型出現(xiàn)在屏幕上。那些紅黃藍綠色密密麻麻的小點,看起來,就像一個由無數(shù)繁星組成的小宇宙。

          這就是人類文明首個表型組導(dǎo)航圖。生命的奧秘,在這些“小宇宙”間閃爍。

        《中國教育報》2025年01月04日 第01版

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